第三十九条 农民专业合作社应当按照国务院财政部门制定的财务会计制度进行财务管理和会计核算。
【释义】本条是关于农民专业合作社财务会计制度的一般规定。
财务会计制度是利用货币价值形式记录和反映合作社财务状况和经营成果，以加强内部经营管理，提高经济效益，增强为成员服务能力的一项重要制度。农民专业合作社作为从事生产经营活动的经济组织，按照财务会计制度进行财务管理和会计核算是其经营过程中必不可少的一项业务活动。
一、农民专业合作社的财务会计制度的作用
1.保护合作社成员的合法权益。成员组建合作社的目的是通过合作社获得自己所需要的各种服务，如共同销售农产品、共同购进农用生产资料等。但这些经营活动主要是由理事、经理和有关工作人员负责的，一般成员很少直接参与。为了防止管理工作人员利用职权侵害成员的合法权益，督促他们提高工作质量和效率，合作社成员必须对合作社的业务活动实施有效的监督。而依据法律、法规和规章以及合作社章程所规定的财务会计制度，由财务人员所记录的会计核算资料，就成为成员监督和评价合作社管理工作成效、维护自身合法权益的重要依据。本法第二十一条的规定，成员享有查阅本社的“财务会计报告、会计账簿和财务审计报告”的权利。第四十条规定：“农民专业合作社的理事长或者理事会应当按照章程规定，组织编制年度业务报告、盈余分配方案、亏损处理方案以及财务会计报告，于成员大会召开的十五日前置备于办公地点，供成员查阅。”这些规定都为成员了解合作社财务情况，督促合作社严格遵守财务会计制度，提供了重要保障。
2.保护合作社债权人的合法权益。本法第五条规定，农民专业合作社对由成员出资、公积金、国家财政直接补助、他人捐赠以及合法取得的其他资产所形成的财产，享有占有、使用和处分的权利，并以上述财产对债务承担责任。第六条规定，农民专业合作社成员以其账户内记载的出资额和公积金份额为限对农民专业合作社承担责任。从以上两条规定可以看出，合作社成员对合作社的经营行为承担的是有限责任，合作社财产的增减变化将直接影响到债权人的权益。因此，依法规范合作社的财务会计行为，提供准确可信的会计信息，是保障债权人及时准确了解合作社财务情况，依法维护自身利益的重要依据。
3.为合作社管理人员提供决策依据。健全的财务会计制度是合作社依法筹集和利用资金、提高经济效益的基本保障，是加强和改善内部经营管理的重要措施。只有按照科学规范的财务会计制度提供准确、系统的财务信息，才能使合作社管理人员准确了解合作社的业务经营情况、预测成本与费用的发展趋势，作为组织开展生产经营活动、合理调整经营策略的重要依据。
4．为国家有关部门作好宏观管理提供准确信息。作为特殊的经济组织形态，国家对农民专业合作社提供了许多优惠扶持政策。合作社严格按财务会计制度核算，有助于相关部门鉴别其与一般企业的区别，从而为制定优惠扶持政策提供依据。此外，国家的扶持政策在合作社是否得到很好的落实，扶持资金是否得到合理有效的使用，也需要通过财务会计活动进行记录并得到反映。
二、农民专业合作社的财务会计制度的重要内容
财务管理包括农民专业合作社资金的筹集、投资项目管理、营运资金管理以及利润分配管理等。具体而言，包括农民专业合作社成员的出资、国家补助和他人捐赠所形成的财产、生产经营所需资金的其他来源、投入领域、成本记载、公积金提取、盈余分配等事项的事前事中事后管理。会计核算是指以资金形式，对农民专业合作社的经营活动进行连续地反映。在生产经营的过程中，农民专业合作社会与其他单位或者个人之间发生各种经济交易，如产品销售，在其内部也会发生具有经济影响的各类事件，如计提折旧。这些活动均应进行会计核算。具体而言，根据会计法的规定，下列经济业务事项，应当办理会计手续，进行会计核算：（1）款项和有价证券的收付；（2）财物的收发、增减和使用；（3）债权债务的发生和结算；（4）资金、基金的增减；（5）收入、支出、费用、成本的计算；（6）财务成果的计算和处理；（7）需要办理会计手续，进行会计核算的其他事项。
鉴于现阶段我国的农民专业合作社大多规模较小、经营过程比较简单，与其他经济组织在财务管理和会计核算方面有一定的不同，国务院财政部门于2007年颁布了《农民专业合作社财务会计制度（试行）》，其中规定，合作社应根据本制度规定和会计业务需要，设置会计账簿，配备必要的人员。不具备条件的，也可以本着民主、自愿的原则，委托农村经营管理机构或代理记账机构代理记账、核算。此外，该制度还针对农民专业合作社的财产类型及收支特点，对农民专业合作社会计账簿的基本要求、会计科目、会计凭证、会计账簿、会计档案等作出了有别于其他经济组织的细致具体的规定和指引。农民专业合作社应当按照该制度规定，进行规范的财务管理和会计核算。
